Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VldlrP98156 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VldlrP98156 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VldlrP98156 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VldlrP98156 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VldlrP98156 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VldlrP98156 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VldlrP98156 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VldlrP98156 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms