Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp1P97350 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms