Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkdcP97313 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkdcP97313 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkdcP97313 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkdcP97313 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkdcP97313 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkdcP97313 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkdcP97313 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkdcP97313 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkdcP97313 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkdcP97313 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkdcP97313 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkdcP97313 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkdcP97313 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkdcP97313 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkdcP97313 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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