Protein–RNA interactions for Protein: P84228

Hist1h3b, Histone H3.2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h3bP84228 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms