Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q6P79568 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms