Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf11P70378 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf11P70378 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf11P70378 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf11P70378 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf11P70378 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf11P70378 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf11P70378 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf11P70378 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf11P70378 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf11P70378 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf11P70378 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf11P70378 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms