Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Casp4P70343 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp4P70343 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp4P70343 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp4P70343 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms