Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp7P70280 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms