Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfixP70257 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfixP70257 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfixP70257 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfixP70257 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfixP70257 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfixP70257 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfixP70257 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfixP70257 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfixP70257 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfixP70257 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfixP70257 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfixP70257 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfixP70257 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfixP70257 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfixP70257 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfixP70257 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfixP70257 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfixP70257 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfixP70257 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfixP70257 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfixP70257 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfixP70257 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfixP70257 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfixP70257 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfixP70257 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfixP70257 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfixP70257 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfixP70257 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NfixP70257 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfixP70257 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfixP70257 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfixP70257 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfixP70257 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NfixP70257 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfixP70257 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NfixP70257 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NfixP70257 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NfixP70257 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NfixP70257 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NfixP70257 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NfixP70257 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NfixP70257 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NfixP70257 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NfixP70257 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NfixP70257 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NfixP70257 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NfixP70257 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
NfixP70257 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NfixP70257 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NfixP70257 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NfixP70257 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NfixP70257 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfixP70257 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NfixP70257 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfixP70257 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfixP70257 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfixP70257 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfixP70257 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfixP70257 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfixP70257 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfixP70257 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfixP70257 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfixP70257 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfixP70257 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NfixP70257 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfixP70257 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NfixP70257 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfixP70257 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfixP70257 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfixP70257 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfixP70257 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NfixP70257 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfixP70257 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfixP70257 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfixP70257 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfixP70257 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfixP70257 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfixP70257 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfixP70257 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfixP70257 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfixP70257 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfixP70257 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfixP70257 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfixP70257 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfixP70257 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfixP70257 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfixP70257 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfixP70257 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfixP70257 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NfixP70257 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfixP70257 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfixP70257 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfixP70257 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfixP70257 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfixP70257 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfixP70257 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfixP70257 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfixP70257 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfixP70257 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms