Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SbdsP70122 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SbdsP70122 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SbdsP70122 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SbdsP70122 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SbdsP70122 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SbdsP70122 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SbdsP70122 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SbdsP70122 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SbdsP70122 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms