Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabrb3P63080 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabrb3P63080 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms