Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crabp1P62965 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms