Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbpl1P62340 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbpl1P62340 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms