Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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