Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufm1P61961 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms