Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Depdc5P61460 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Depdc5P61460 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms