Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg6P61406 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg6P61406 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg6P61406 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg6P61406 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg6P61406 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg6P61406 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg6P61406 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg6P61406 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smg6P61406 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg6P61406 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg6P61406 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg6P61406 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg6P61406 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms