Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2nP61089 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2nP61089 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2nP61089 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2nP61089 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2nP61089 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms