Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps33bP59016 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms