Protein–RNA interactions for Protein: P57791

Rce1, CAAX prenyl protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rce1P57791 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rce1P57791 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rce1P57791 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rce1P57791 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rce1P57791 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rce1P57791 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rce1P57791 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rce1P57791 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms