Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp5P56399 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp5P56399 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp5P56399 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp5P56399 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp5P56399 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp5P56399 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp5P56399 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp5P56399 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp5P56399 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms