Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acod1P54987 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Acod1P54987 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acod1P54987 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acod1P54987 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Acod1P54987 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acod1P54987 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms