Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp1P52624 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp1P52624 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp1P52624 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp1P52624 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp1P52624 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp1P52624 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp1P52624 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms