Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms