Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LumP51885 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LumP51885 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LumP51885 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LumP51885 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LumP51885 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LumP51885 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LumP51885 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LumP51885 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LumP51885 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LumP51885 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LumP51885 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LumP51885 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LumP51885 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LumP51885 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LumP51885 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LumP51885 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LumP51885 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LumP51885 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LumP51885 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LumP51885 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LumP51885 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LumP51885 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LumP51885 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
LumP51885 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LumP51885 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LumP51885 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LumP51885 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LumP51885 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LumP51885 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LumP51885 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LumP51885 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LumP51885 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LumP51885 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LumP51885 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LumP51885 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LumP51885 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LumP51885 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LumP51885 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LumP51885 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LumP51885 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LumP51885 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LumP51885 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LumP51885 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LumP51885 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LumP51885 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LumP51885 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LumP51885 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LumP51885 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LumP51885 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LumP51885 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LumP51885 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LumP51885 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LumP51885 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LumP51885 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LumP51885 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LumP51885 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LumP51885 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LumP51885 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LumP51885 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LumP51885 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LumP51885 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LumP51885 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LumP51885 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LumP51885 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LumP51885 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LumP51885 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LumP51885 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LumP51885 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LumP51885 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LumP51885 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LumP51885 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LumP51885 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LumP51885 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LumP51885 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LumP51885 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LumP51885 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LumP51885 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LumP51885 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LumP51885 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LumP51885 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LumP51885 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LumP51885 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LumP51885 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LumP51885 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LumP51885 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LumP51885 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LumP51885 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LumP51885 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LumP51885 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LumP51885 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LumP51885 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LumP51885 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LumP51885 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LumP51885 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LumP51885 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LumP51885 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LumP51885 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LumP51885 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LumP51885 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms