Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CastP51125 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CastP51125 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CastP51125 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CastP51125 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CastP51125 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CastP51125 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CastP51125 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CastP51125 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CastP51125 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CastP51125 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CastP51125 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CastP51125 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CastP51125 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CastP51125 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CastP51125 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CastP51125 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CastP51125 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CastP51125 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CastP51125 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CastP51125 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CastP51125 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CastP51125 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CastP51125 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CastP51125 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CastP51125 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CastP51125 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CastP51125 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CastP51125 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CastP51125 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CastP51125 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CastP51125 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CastP51125 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CastP51125 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CastP51125 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CastP51125 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CastP51125 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CastP51125 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CastP51125 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CastP51125 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CastP51125 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CastP51125 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CastP51125 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CastP51125 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CastP51125 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CastP51125 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CastP51125 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CastP51125 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CastP51125 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CastP51125 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CastP51125 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CastP51125 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CastP51125 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CastP51125 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CastP51125 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CastP51125 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CastP51125 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CastP51125 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CastP51125 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CastP51125 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CastP51125 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CastP51125 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CastP51125 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CastP51125 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CastP51125 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CastP51125 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CastP51125 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CastP51125 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CastP51125 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CastP51125 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CastP51125 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CastP51125 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CastP51125 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CastP51125 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CastP51125 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CastP51125 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CastP51125 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CastP51125 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CastP51125 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CastP51125 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CastP51125 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CastP51125 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CastP51125 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CastP51125 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CastP51125 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CastP51125 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CastP51125 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CastP51125 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CastP51125 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CastP51125 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CastP51125 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CastP51125 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CastP51125 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CastP51125 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CastP51125 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CastP51125 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CastP51125 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CastP51125 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CastP51125 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CastP51125 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms