Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TspoP50637 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TspoP50637 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TspoP50637 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TspoP50637 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TspoP50637 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TspoP50637 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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TspoP50637 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TspoP50637 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TspoP50637 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TspoP50637 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TspoP50637 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TspoP50637 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TspoP50637 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TspoP50637 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TspoP50637 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TspoP50637 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TspoP50637 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TspoP50637 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TspoP50637 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TspoP50637 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TspoP50637 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TspoP50637 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TspoP50637 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TspoP50637 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TspoP50637 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TspoP50637 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TspoP50637 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TspoP50637 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TspoP50637 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TspoP50637 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TspoP50637 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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