Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms