Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LmnaP48678 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LmnaP48678 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LmnaP48678 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LmnaP48678 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LmnaP48678 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms