Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TgfaP48030 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TgfaP48030 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TgfaP48030 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TgfaP48030 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TgfaP48030 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TgfaP48030 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TgfaP48030 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TgfaP48030 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TgfaP48030 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TgfaP48030 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TgfaP48030 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TgfaP48030 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TgfaP48030 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TgfaP48030 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TgfaP48030 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TgfaP48030 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TgfaP48030 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TgfaP48030 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TgfaP48030 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TgfaP48030 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TgfaP48030 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TgfaP48030 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TgfaP48030 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TgfaP48030 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TgfaP48030 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TgfaP48030 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms