Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli1P47806 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli1P47806 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli1P47806 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gli1P47806 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gli1P47806 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gli1P47806 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms