Protein–RNA interactions for Protein: P43241

Cdx2, Homeobox protein CDX-2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx2P43241 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdx2P43241 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdx2P43241 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms