Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdf5P43027 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms