Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms