Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tnfsf9P41274 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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