Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Csf3rP40223 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Csf3rP40223 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csf3rP40223 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csf3rP40223 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms