Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik2P39087 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Grik2P39087 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik2P39087 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik2P39087 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik2P39087 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms