Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtlP38585 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtlP38585 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtlP38585 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtlP38585 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtlP38585 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtlP38585 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtlP38585 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtlP38585 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtlP38585 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtlP38585 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtlP38585 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtlP38585 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtlP38585 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtlP38585 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtlP38585 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtlP38585 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtlP38585 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtlP38585 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtlP38585 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtlP38585 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtlP38585 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtlP38585 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TtlP38585 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TtlP38585 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtlP38585 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtlP38585 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtlP38585 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtlP38585 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtlP38585 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtlP38585 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtlP38585 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtlP38585 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtlP38585 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtlP38585 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TtlP38585 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtlP38585 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtlP38585 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtlP38585 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtlP38585 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtlP38585 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtlP38585 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtlP38585 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtlP38585 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtlP38585 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtlP38585 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtlP38585 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtlP38585 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TtlP38585 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TtlP38585 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtlP38585 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtlP38585 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtlP38585 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtlP38585 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtlP38585 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtlP38585 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtlP38585 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtlP38585 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtlP38585 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtlP38585 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtlP38585 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TtlP38585 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TtlP38585 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TtlP38585 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TtlP38585 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TtlP38585 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TtlP38585 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TtlP38585 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TtlP38585 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TtlP38585 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TtlP38585 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TtlP38585 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TtlP38585 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TtlP38585 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TtlP38585 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TtlP38585 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TtlP38585 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TtlP38585 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TtlP38585 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TtlP38585 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TtlP38585 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TtlP38585 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TtlP38585 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TtlP38585 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TtlP38585 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TtlP38585 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TtlP38585 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TtlP38585 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TtlP38585 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TtlP38585 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TtlP38585 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TtlP38585 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TtlP38585 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TtlP38585 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TtlP38585 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TtlP38585 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TtlP38585 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TtlP38585 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TtlP38585 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TtlP38585 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms