Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sar1aP36536 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms