Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sftpa1P35242 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms