Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms