Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms