Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pola1P33609 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pola1P33609 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pola1P33609 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pola1P33609 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pola1P33609 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pola1P33609 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pola1P33609 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pola1P33609 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pola1P33609 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pola1P33609 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms