Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms