Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxc11P31313 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms