Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprmP28828 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprmP28828 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprmP28828 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprmP28828 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PtprmP28828 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PtprmP28828 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprmP28828 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprmP28828 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprmP28828 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprmP28828 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprmP28828 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprmP28828 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
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