Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vav1P27870 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vav1P27870 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vav1P27870 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vav1P27870 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vav1P27870 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vav1P27870 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vav1P27870 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav1P27870 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav1P27870 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav1P27870 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav1P27870 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav1P27870 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms