Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna1P26231 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna1P26231 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms