Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd12P23812 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms