Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18532 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18532 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18532 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18532 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18532 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18532 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18532 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18532 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18532 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18532 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18532 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18532 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18532 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18532 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18532 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18532 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18532 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18532 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18532 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18532 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18532 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18532 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18532 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18532 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18532 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18532 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18532 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18532 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18532 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18532 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18532 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18532 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18532 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18532 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18532 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18532 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18532 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18532 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18532 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18532 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18532 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18532 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18532 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18532 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18532 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18532 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18532 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18532 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms